Фотореактивация

Типы и механизмы репарации.

Ферменты репарации

Эндонуклеазы – расщепляют связи внутри ДНК.

Экзонуклеазы – расщепляют связи с концов, могут быть специфичными для 5‘ и 3‘ концов ДНК.

ДНК-полимеразы – заполняют брешь, используя комплементарнуюцепь в виде матрицы.

Лигаза – катализирует образование фосфорнодиэфирных связей, используя энергию гидролиза АТФ.

ДНК-гликозилаза – расщепляет N-гликозидную связь.

АР-эндонуклеза – разрезает ДНК в апуриновых или апиримидиновых участках с образованием 5‘ конца

Прямая репарация ДНК

Прямое восстановление исходной структуры ДНК или удаление повреждения (структура поврежденного нуклеотида восстанавливается без его вырезания)

n Фотореактивация пиримидиновых димеров;

n репарацию ДНК за счет 3’-5’-экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы;

n репарацию одноцепочечных разрывов ДНК с помощью полинуклеотидлигазы;

n генетическую репарацию повреждений, вызванных алкильными или метильными группами, путем удаления этих групп специфическими ферментами. Метилтрансферазнаяактивность(гликозилаз удаляют метильные группы)

Эксцизионная репарация

Репарация с удалением поврежденных

оснований

- удаление одного нуклеотида

- удаление фрагмента ДНК

n мисмэтч репарация

Индуцируемая репарация

SOS-репарация

Рекомбинативная репарация

– прямая репарация,происходит у бактерий на свету при участии специального фермента – фотолиазы,

Этапы:

1. Активация фотолиазы под действием света (путем дестабилизации ее электронов)

2. Перенос электронов в пиримидиновый цикл и ослабление связи с пентозой

3. Освобождение азотистого основания и замена на новое

Репарация путем удаления нуклеотидов - (NER)

восстановление достаточно длинных фрагментов ДНК.

Этапы:

· Белковый комплекс (XPA-PRA) распознает дефектный участок;

· Нуклеаза производит разрыв на расстоянии 5 пнот 3’ конца и 8 пн от 5’конца;

· Образованная брешь заполняется при помощи ДНК-полимераз δ и ε;

ДНК-лигаза сшивает концы.